Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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PTPRCAPQ14761 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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PTPRCAPQ14761 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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PTPRCAPQ14761 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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PTPRCAPQ14761 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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PTPRCAPQ14761 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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PTPRCAPQ14761 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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PTPRCAPQ14761 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRCAPQ14761 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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