Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms