Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DEUP1Q05D60 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms