Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms