Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms