Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TFAMQ00059 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms