Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IRX1P78414 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IRX1P78414 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IRX1P78414 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IRX1P78414 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IRX1P78414 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IRX1P78414 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IRX1P78414 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IRX1P78414 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IRX1P78414 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IRX1P78414 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
IRX1P78414 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IRX1P78414 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
IRX1P78414 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IRX1P78414 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IRX1P78414 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IRX1P78414 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IRX1P78414 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IRX1P78414 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IRX1P78414 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IRX1P78414 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IRX1P78414 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IRX1P78414 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IRX1P78414 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IRX1P78414 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IRX1P78414 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IRX1P78414 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IRX1P78414 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IRX1P78414 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IRX1P78414 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
IRX1P78414 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
IRX1P78414 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IRX1P78414 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IRX1P78414 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IRX1P78414 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IRX1P78414 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IRX1P78414 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IRX1P78414 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IRX1P78414 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IRX1P78414 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IRX1P78414 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IRX1P78414 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IRX1P78414 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IRX1P78414 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IRX1P78414 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
IRX1P78414 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
IRX1P78414 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IRX1P78414 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
IRX1P78414 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IRX1P78414 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IRX1P78414 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IRX1P78414 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IRX1P78414 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IRX1P78414 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IRX1P78414 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IRX1P78414 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IRX1P78414 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IRX1P78414 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IRX1P78414 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IRX1P78414 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IRX1P78414 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
IRX1P78414 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IRX1P78414 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IRX1P78414 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
IRX1P78414 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IRX1P78414 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
IRX1P78414 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IRX1P78414 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IRX1P78414 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IRX1P78414 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IRX1P78414 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IRX1P78414 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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IRX1P78414 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IRX1P78414 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IRX1P78414 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IRX1P78414 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IRX1P78414 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
IRX1P78414 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
IRX1P78414 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
IRX1P78414 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IRX1P78414 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IRX1P78414 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IRX1P78414 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IRX1P78414 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IRX1P78414 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IRX1P78414 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IRX1P78414 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IRX1P78414 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IRX1P78414 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IRX1P78414 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IRX1P78414 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IRX1P78414 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IRX1P78414 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
IRX1P78414 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IRX1P78414 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IRX1P78414 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
IRX1P78414 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
IRX1P78414 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
IRX1P78414 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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