Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GNB1P62873 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GNB1P62873 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GNB1P62873 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GNB1P62873 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GNB1P62873 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GNB1P62873 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GNB1P62873 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GNB1P62873 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GNB1P62873 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GNB1P62873 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GNB1P62873 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GNB1P62873 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GNB1P62873 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GNB1P62873 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GNB1P62873 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GNB1P62873 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GNB1P62873 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GNB1P62873 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GNB1P62873 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GNB1P62873 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GNB1P62873 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GNB1P62873 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GNB1P62873 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GNB1P62873 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GNB1P62873 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GNB1P62873 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GNB1P62873 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GNB1P62873 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GNB1P62873 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GNB1P62873 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GNB1P62873 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GNB1P62873 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GNB1P62873 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GNB1P62873 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GNB1P62873 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GNB1P62873 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
GNB1P62873 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GNB1P62873 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GNB1P62873 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GNB1P62873 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GNB1P62873 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
GNB1P62873 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GNB1P62873 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
GNB1P62873 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GNB1P62873 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GNB1P62873 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GNB1P62873 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
GNB1P62873 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GNB1P62873 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GNB1P62873 CACNA1G-232ENST00000515411 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GNB1P62873 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GNB1P62873 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GNB1P62873 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GNB1P62873 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GNB1P62873 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GNB1P62873 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GNB1P62873 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GNB1P62873 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GNB1P62873 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GNB1P62873 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GNB1P62873 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GNB1P62873 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GNB1P62873 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GNB1P62873 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GNB1P62873 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GNB1P62873 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GNB1P62873 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GNB1P62873 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GNB1P62873 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GNB1P62873 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GNB1P62873 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GNB1P62873 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
GNB1P62873 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GNB1P62873 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GNB1P62873 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GNB1P62873 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
GNB1P62873 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GNB1P62873 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
GNB1P62873 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GNB1P62873 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GNB1P62873 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
GNB1P62873 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
GNB1P62873 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
GNB1P62873 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GNB1P62873 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GNB1P62873 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GNB1P62873 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GNB1P62873 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GNB1P62873 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GNB1P62873 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GNB1P62873 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
GNB1P62873 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
GNB1P62873 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GNB1P62873 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GNB1P62873 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
GNB1P62873 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GNB1P62873 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
GNB1P62873 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
GNB1P62873 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms