Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ACTBP60709 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
ACTBP60709 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ACTBP60709 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ACTBP60709 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ACTBP60709 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ACTBP60709 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ACTBP60709 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ACTBP60709 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ACTBP60709 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ACTBP60709 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ACTBP60709 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ACTBP60709 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ACTBP60709 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ACTBP60709 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ACTBP60709 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ACTBP60709 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ACTBP60709 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ACTBP60709 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ACTBP60709 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ACTBP60709 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ACTBP60709 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
ACTBP60709 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ACTBP60709 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ACTBP60709 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
ACTBP60709 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ACTBP60709 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ACTBP60709 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ACTBP60709 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ACTBP60709 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
ACTBP60709 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
ACTBP60709 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ACTBP60709 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ACTBP60709 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ACTBP60709 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ACTBP60709 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ACTBP60709 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ACTBP60709 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
ACTBP60709 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ACTBP60709 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ACTBP60709 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ACTBP60709 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ACTBP60709 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ACTBP60709 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ACTBP60709 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ACTBP60709 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ACTBP60709 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ACTBP60709 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ACTBP60709 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ACTBP60709 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ACTBP60709 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ACTBP60709 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ACTBP60709 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ACTBP60709 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ACTBP60709 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ACTBP60709 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ACTBP60709 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ACTBP60709 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ACTBP60709 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ACTBP60709 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ACTBP60709 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ACTBP60709 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ACTBP60709 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ACTBP60709 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ACTBP60709 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ACTBP60709 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ACTBP60709 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ACTBP60709 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ACTBP60709 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ACTBP60709 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ACTBP60709 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ACTBP60709 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ACTBP60709 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ACTBP60709 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ACTBP60709 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ACTBP60709 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ACTBP60709 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ACTBP60709 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ACTBP60709 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ACTBP60709 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ACTBP60709 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ACTBP60709 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ACTBP60709 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ACTBP60709 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ACTBP60709 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ACTBP60709 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ACTBP60709 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ACTBP60709 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ACTBP60709 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ACTBP60709 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ACTBP60709 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ACTBP60709 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ACTBP60709 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ACTBP60709 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ACTBP60709 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ACTBP60709 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ACTBP60709 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ACTBP60709 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ACTBP60709 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ACTBP60709 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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