Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 LINC02318-201ENST00000553785 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 AC008040.1-204ENST00000469301 1738 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 AC093835.1-201ENST00000508072 568 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 AC068408.1-201ENST00000577406 1144 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSEN1P49768 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms