Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRXP46100 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRXP46100 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRXP46100 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRXP46100 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRXP46100 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRXP46100 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRXP46100 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRXP46100 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRXP46100 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRXP46100 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRXP46100 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRXP46100 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRXP46100 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRXP46100 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRXP46100 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRXP46100 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRXP46100 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRXP46100 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRXP46100 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRXP46100 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRXP46100 HMGA1P2-201ENST00000430198 324 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRXP46100 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRXP46100 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRXP46100 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRXP46100 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRXP46100 TPST2P1-201ENST00000564073 1102 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRXP46100 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRXP46100 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRXP46100 AC008764.4-207ENST00000600705 956 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRXP46100 RDM1-216ENST00000613308 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRXP46100 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRXP46100 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRXP46100 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRXP46100 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRXP46100 LINC00682-202ENST00000499082 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRXP46100 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRXP46100 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRXP46100 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRXP46100 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRXP46100 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRXP46100 AKIP1-203ENST00000309377 1327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRXP46100 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRXP46100 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRXP46100 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRXP46100 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRXP46100 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRXP46100 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRXP46100 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRXP46100 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRXP46100 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRXP46100 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRXP46100 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRXP46100 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRXP46100 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRXP46100 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRXP46100 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRXP46100 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRXP46100 PTPN20-229ENST00000513756 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRXP46100 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRXP46100 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRXP46100 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRXP46100 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRXP46100 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRXP46100 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRXP46100 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRXP46100 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRXP46100 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRXP46100 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRXP46100 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRXP46100 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRXP46100 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRXP46100 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRXP46100 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRXP46100 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRXP46100 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRXP46100 AC009517.1-201ENST00000454750 570 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRXP46100 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRXP46100 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRXP46100 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRXP46100 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRXP46100 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRXP46100 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRXP46100 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRXP46100 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRXP46100 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRXP46100 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRXP46100 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRXP46100 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRXP46100 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRXP46100 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRXP46100 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRXP46100 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRXP46100 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRXP46100 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRXP46100 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRXP46100 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRXP46100 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRXP46100 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRXP46100 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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