Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MDH1P40925 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MDH1P40925 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MDH1P40925 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MDH1P40925 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MDH1P40925 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MDH1P40925 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MDH1P40925 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MDH1P40925 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MDH1P40925 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MDH1P40925 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MDH1P40925 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MDH1P40925 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MDH1P40925 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MDH1P40925 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MDH1P40925 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MDH1P40925 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MDH1P40925 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MDH1P40925 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MDH1P40925 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MDH1P40925 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
MDH1P40925 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MDH1P40925 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MDH1P40925 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MDH1P40925 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MDH1P40925 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MDH1P40925 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MDH1P40925 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MDH1P40925 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MDH1P40925 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MDH1P40925 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MDH1P40925 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MDH1P40925 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MDH1P40925 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MDH1P40925 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MDH1P40925 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MDH1P40925 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MDH1P40925 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MDH1P40925 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MDH1P40925 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MDH1P40925 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MDH1P40925 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MDH1P40925 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MDH1P40925 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MDH1P40925 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MDH1P40925 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MDH1P40925 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MDH1P40925 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MDH1P40925 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MDH1P40925 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MDH1P40925 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MDH1P40925 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MDH1P40925 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MDH1P40925 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MDH1P40925 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MDH1P40925 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MDH1P40925 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MDH1P40925 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MDH1P40925 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MDH1P40925 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MDH1P40925 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MDH1P40925 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MDH1P40925 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MDH1P40925 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MDH1P40925 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MDH1P40925 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MDH1P40925 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MDH1P40925 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
MDH1P40925 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MDH1P40925 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MDH1P40925 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MDH1P40925 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MDH1P40925 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MDH1P40925 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MDH1P40925 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MDH1P40925 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MDH1P40925 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MDH1P40925 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MDH1P40925 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MDH1P40925 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MDH1P40925 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MDH1P40925 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
MDH1P40925 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MDH1P40925 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MDH1P40925 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MDH1P40925 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MDH1P40925 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MDH1P40925 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MDH1P40925 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MDH1P40925 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MDH1P40925 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MDH1P40925 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MDH1P40925 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MDH1P40925 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MDH1P40925 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MDH1P40925 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MDH1P40925 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MDH1P40925 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MDH1P40925 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MDH1P40925 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms