Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTN2P35609 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms