Protein–RNA interactions for Protein: P34096

RNASE4, Ribonuclease 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNASE4P34096 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNASE4P34096 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNASE4P34096 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNASE4P34096 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNASE4P34096 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNASE4P34096 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNASE4P34096 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNASE4P34096 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNASE4P34096 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNASE4P34096 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNASE4P34096 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNASE4P34096 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNASE4P34096 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNASE4P34096 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNASE4P34096 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNASE4P34096 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
RNASE4P34096 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNASE4P34096 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNASE4P34096 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNASE4P34096 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
RNASE4P34096 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNASE4P34096 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNASE4P34096 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNASE4P34096 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNASE4P34096 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
RNASE4P34096 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
RNASE4P34096 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
RNASE4P34096 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNASE4P34096 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
RNASE4P34096 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNASE4P34096 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNASE4P34096 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNASE4P34096 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
RNASE4P34096 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNASE4P34096 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
RNASE4P34096 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNASE4P34096 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNASE4P34096 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNASE4P34096 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNASE4P34096 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNASE4P34096 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNASE4P34096 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
RNASE4P34096 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNASE4P34096 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNASE4P34096 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNASE4P34096 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNASE4P34096 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNASE4P34096 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNASE4P34096 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNASE4P34096 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNASE4P34096 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNASE4P34096 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNASE4P34096 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNASE4P34096 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNASE4P34096 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNASE4P34096 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNASE4P34096 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNASE4P34096 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNASE4P34096 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNASE4P34096 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNASE4P34096 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
RNASE4P34096 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
RNASE4P34096 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
RNASE4P34096 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
RNASE4P34096 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
RNASE4P34096 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
RNASE4P34096 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
RNASE4P34096 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
RNASE4P34096 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
RNASE4P34096 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
RNASE4P34096 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
RNASE4P34096 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
RNASE4P34096 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
RNASE4P34096 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNASE4P34096 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms