Protein–RNA interactions for Protein: P0CG33

GOLGA6D, Golgin subfamily A member 6D, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6DP0CG33 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6DP0CG33 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms