Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4BP0C0L5 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms