Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOP08100 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOP08100 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOP08100 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOP08100 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOP08100 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOP08100 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOP08100 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOP08100 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOP08100 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOP08100 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOP08100 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOP08100 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOP08100 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOP08100 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOP08100 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOP08100 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOP08100 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOP08100 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOP08100 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOP08100 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOP08100 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOP08100 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOP08100 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOP08100 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOP08100 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOP08100 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOP08100 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOP08100 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOP08100 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOP08100 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOP08100 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOP08100 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOP08100 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOP08100 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOP08100 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOP08100 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOP08100 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOP08100 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOP08100 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOP08100 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOP08100 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOP08100 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOP08100 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOP08100 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOP08100 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOP08100 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOP08100 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOP08100 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOP08100 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOP08100 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOP08100 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOP08100 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOP08100 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOP08100 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOP08100 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOP08100 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOP08100 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOP08100 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOP08100 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOP08100 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOP08100 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOP08100 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOP08100 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOP08100 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOP08100 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOP08100 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOP08100 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOP08100 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOP08100 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOP08100 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOP08100 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOP08100 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOP08100 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOP08100 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOP08100 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOP08100 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOP08100 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOP08100 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOP08100 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOP08100 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOP08100 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOP08100 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOP08100 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOP08100 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOP08100 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOP08100 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOP08100 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOP08100 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOP08100 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOP08100 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOP08100 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOP08100 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOP08100 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOP08100 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOP08100 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOP08100 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOP08100 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOP08100 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOP08100 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms