Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms