Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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TRAF6Q9Y4K3 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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TRAF6Q9Y4K3 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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TRAF6Q9Y4K3 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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TRAF6Q9Y4K3 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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TRAF6Q9Y4K3 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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TRAF6Q9Y4K3 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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TRAF6Q9Y4K3 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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TRAF6Q9Y4K3 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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TRAF6Q9Y4K3 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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TRAF6Q9Y4K3 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAF6Q9Y4K3 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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