Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC8Q9Y2L5 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms