Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms