Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYTH4Q9UIA0 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms