Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC17A6Q9P2U8 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC17A6Q9P2U8 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC17A6Q9P2U8 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC17A6Q9P2U8 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC17A6Q9P2U8 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC17A6Q9P2U8 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC17A6Q9P2U8 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC17A6Q9P2U8 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC17A6Q9P2U8 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SLC17A6Q9P2U8 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SLC17A6Q9P2U8 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC17A6Q9P2U8 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SLC17A6Q9P2U8 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SLC17A6Q9P2U8 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC17A6Q9P2U8 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SLC17A6Q9P2U8 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SLC17A6Q9P2U8 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC17A6Q9P2U8 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC17A6Q9P2U8 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SLC17A6Q9P2U8 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC17A6Q9P2U8 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC17A6Q9P2U8 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC17A6Q9P2U8 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC17A6Q9P2U8 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SLC17A6Q9P2U8 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC17A6Q9P2U8 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC17A6Q9P2U8 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC17A6Q9P2U8 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC17A6Q9P2U8 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC17A6Q9P2U8 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC17A6Q9P2U8 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC17A6Q9P2U8 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC17A6Q9P2U8 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC17A6Q9P2U8 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC17A6Q9P2U8 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC17A6Q9P2U8 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC17A6Q9P2U8 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC17A6Q9P2U8 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC17A6Q9P2U8 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC17A6Q9P2U8 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC17A6Q9P2U8 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC17A6Q9P2U8 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC17A6Q9P2U8 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC17A6Q9P2U8 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC17A6Q9P2U8 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC17A6Q9P2U8 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC17A6Q9P2U8 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms