Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CHPF2Q9P2E5 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHPF2Q9P2E5 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms