Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
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SH3BP4Q9P0V3 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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SH3BP4Q9P0V3 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
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