Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms