Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ARFGAP3Q9NP61 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.1 ms