Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRDM12Q9H4Q4 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms