Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NYXQ9GZU5 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms