Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSV6

TSEN34, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen34, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSEN34Q9BSV6 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TSEN34Q9BSV6 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSEN34Q9BSV6 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSEN34Q9BSV6 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSEN34Q9BSV6 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSEN34Q9BSV6 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSEN34Q9BSV6 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms