Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms