Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms