Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQA5

HINFP, Histone H4 transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HINFPQ9BQA5 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.3 ms