Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms