Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms