Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
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GTF3C6Q969F1 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
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GTF3C6Q969F1 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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GTF3C6Q969F1 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
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