Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB6

DTX3L, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3LQ8TDB6 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms