Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SEMA6DQ8NFY4 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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