Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms