Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPFIBP1Q86W92 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms