Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
WSCD1Q658N2 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms