Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms