Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms