Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 LST1-205ENST00000376089 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 LST1-206ENST00000376090 689 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 LST1-209ENST00000376096 565 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 LST1-212ENST00000396101 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 LST1-214ENST00000418507 726 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms