Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKJ3

CTC1, CST complex subunit CTC1, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1Q2NKJ3 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTC1Q2NKJ3 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms