Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HIST3H3Q16695 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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