Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FSCN1Q16658 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms