Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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CTF1Q16619 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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CTF1Q16619 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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CTF1Q16619 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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CTF1Q16619 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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CTF1Q16619 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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CTF1Q16619 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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CTF1Q16619 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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CTF1Q16619 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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