Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms