Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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